Die Flusseeschwalbe ist regelmäßiger Brutvogel im Oderbruch an den Altfriedländer Teichen und sehr selten einzelpaarweise und, leider nie erfolgreich, an der Oder. An den Randbereichen findet man gelegentlich Bruten an den Lietzener Teichen und den dortigen Seen.
Sie tritt auf dem Zug regelmäßig auch außerhalb der Leitlinie Oder auf, wenngleich sie die Nähe größerer Gewässer vorzieht.